Des de 1987, aquest jardí botànic s'ha recuperat com a centre investigador i docent de la Universitat de València. Està adscrit directament al Rectorat.
En l'actualitat es treballa en la preservació del jardí històric i en la seua continuïtat com a centre d'estudi, cerca, desenvolupament i divulgació de la botànica. El Jardí Botànic de València disposa de biblioteca, herbari i banc de germoplasma (llavors i espores).
En el Botànic de València s'investiga sobre flora, biosistemes i vegetació. També es participa en projectes internacionals relacionats amb la biodiversitat vegetal i l'estudi de les plantes autòctones.
El Jardí Botànic de València compta amb més de 3.000 espècies vegetals.
El Jardí Botànic de València també promou congressos d'especialistes, a més de jornades, trobades i exposicions divulgatives.
Aquest jardí té una gran col·lecció de cactus i altres plantes del desert.