Desde 1987, este jardín botánico se ha recuperado como centro investigador y docente de la Universidad de Valencia. Está adscrito directamente al Rectorado.

En la actualidad se trabaja en la preservación del jardín histórico y en su continuidad como centro de estudio, búsqueda, desarrollo y divulgación de la botánica. El Jardín Botánico de Valencia dispone de biblioteca, herbario y banco de germoplasma (semillas y esporas).

En el Botánico de Valencia se investiga sobre flora, biosistemas y vegetación. También se participa en proyectos internacionales relacionados con la biodiversidad vegetal y el estudio de las plantas autóctonas. 

El Jardín Botánico de Valencia cuenta con más de 3.000 especies vegetales.

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